徐大椿，出生在书香之家，长辈们寄以读书做官、承继祖业、克振家声的希望，然而他淡泊功名利禄，十四岁的时候私塾的八股文已经满足不了他的求知欲。于是，他开始自学《易经》、《道德经》。他不仅看书，还给《道德经》写了一本注释。这本书写了二十年，出版之后还被收录到《四库全书》里面。
徐大椿家人多病，一开始是三弟生病，请来了许多医生为其治病，与此同时，他的四弟、五弟也都病倒了，很快便病故了。其父亲因为过度地悲伤也病倒了。在接下来的几年里，家人们都相继去世，只留下徐大椿和他母亲两人。也因此，他深感到医学的重要，也气愤当时庸医的医术低下，便愤而学医，通过博览医籍自学成医。
根据《徐灵胎先生传》记载，徐大椿于乾隆四年在姑苏城西阊门创立医馆太一堂，秉承“太一济世，仁德立身”之精神，行医济世，治病救人，造福百姓。
徐大椿一生治好了不知多少病人，其医术至高明，可谓是全国知晓。乾隆二十五年，文华殿大学士蒋溥患重病，太医们对此都束手无策，而刑部尚书秦惠田，对徐大椿的医术有所耳闻，便向皇帝推荐了他，皇帝听后召他进京，因自身原因，徐大椿于第二年正月进京为大学士诊病，得出“过立夏七日则休矣”这一结论，后来大学士确如他所说于四月立夏过后逝世。于是乾隆想将他留在太医院供职，但徐大椿以年迈多病为由，执意返回故里。
乾隆三十六年，乾隆再次召徐大椿进京，但此时他已经是79岁的老人了，推辞已属枉然，农历十月二十五，徐大椿与儿子徐曦启程，他自知衰老力弱，千里奔走，恐难返还，便带一具寿棺一起进京，准备途中随死虽殓。果然在到京的第三天他就病死了。临终前自拟墓门对联一副：“满山灵草仙人药，一径松风处士坟”。到了晚上，谈笑而逝。乾隆对此十分惋惜，赐金赠官后，传旨让徐曦护柩回乡。