《孙文垣医案》是《赤水玄珠全集》（又称《孙一奎医学全书》）内之一种，由孙一奎之子编辑，成书于明万历元年（1573），一名《赤水玄珠医案》，又名《生生子医案》，按孙氏临证所在地区不同而分为《三吴治验》（一、二卷）、《新都治验》（三、四卷）及《宜兴治验》（五卷）