朱丹溪小的时候，读书能过目成诵，日记千言，言章词赋，一挥即成。听说著名理学家许文懿在东阳八华山中讲学，专门传授朱熹的理学，他对许文懿讲授那套理学非常崇拜，听了后，“自悔昔之沉冥颠齐，汗下如雨”。他“每宵挟册，坐至四鼓，潜验默察，必欲见诸实践”。这样，他坚持学了几年，日有所悟，学业大进，成了一个学识渊博的“东南大儒”。
朱丹溪14岁时，父亲因病去世，母亲一人承担起朱丹溪和他两个年幼弟弟的教育重任，也正是因为他的教育并未有所松懈，才为以后成才打下了基础。他青年时为人正直，仗义执言，凡是认为对的事情都要据理力争，就连面对官府都不会退缩，也正因此派培养了朱丹溪刚正不阿的性格特点，为以后中国古代哲学和医学打下了良好的人格基础。此外，朱丹溪还积极组织大家一起兴修水利，为民谋福，在他的带领下，家乡能灌溉农田六千多亩的蜀墅塘，被修缮好，并并开凿了三条渠道，根据水量而舒洩之，使百姓均得受益。
朱丹溪30岁时，其母患严重的脾病，脾痛剧烈，当地名医都束手无策，丹溪为救母疾，遂苦读《黄帝内经》，经过3年的研读，终于治好母亲病患，并感慨：“医者，儒家格物致知一事，养亲不可缺”。
36岁时朱丹溪拜入许谦的门下，4年的时间让他的哲学能力有了很大的提高。在此期间他曾参加过两次科举考试，但并未考中。后来，在许谦的建议下，决定断绝仕途，专心从事医学事业。之后又拜入罗知悌门下学习。一年半后，罗知悌去世。朱丹溪安葬了师傅后回到义务老家，为百病治病。四方求治者、求学者盈门不绝。朱丹溪总是有求必应，不避风雨，致使贴身仆人均难受其苦，怨声不绝。
朱丹溪晚年整理自己的行医经验与心得，写成许多著作。临终前没有其他嘱咐，只将随他学医的侄儿叫到面前诲之曰：“医学亦难矣，汝谨识之。”言讫，端坐而逝。