朱丹溪的学说，后世有褒和贬，但以褒为主。如明代医家方广说：“求其可以为万世法者，张长沙外感，李东垣内伤，刘河间热证，朱丹溪杂病，数者而已。然而丹溪实又贯通乎诸君子，尤号集医道之大成者也”（《丹溪心法附余》序）。但由于朱丹溪只明一义，过分强调了“阳有余”的一面，而不谈阳也有亏损的一面；在临床上太强调“滋阴降火”，因此，未免有它的片面性，从而遭到后人的激烈反对。 张介宾也因其执着一端而攻之不遗余力，说：“丹溪之言火多者，谓热药能杀人。而余察其为寒多者，则但见寒药之杀人耳”（《景岳全书》）。历代对朱丹溪的学说评价，尽管有褒有贬，但总的来说，朱丹溪的学说在国内外仍有很大影响，在祖国医学史上占有光辉的一面。日本医家曾成立“丹溪学社”，专门研究丹溪的学说。
纵观朱丹溪一生，有苦有泪，尤其是当他立在风雨中，乞求罗知悌收他为徒，教他习医时的情景，我们不难想象出他的毅力，为了一个目的，即使千折百转，不达目的仍誓不罢休。就是到了今天，这种精神仍值得我们学习。所以说，他不仅在医学方面，就是在做事方面，思想方面，也为我们积下了一笔可贵的财富，不愧为一代名医，一代名人。朱丹溪的医学成就，主要是“相火论”、“阳有余阴不足论”，并在此基础上，确立“滋阴降火”的治则，倡导滋阴学说及《局方发挥》一书，对杂病创气、血、痰、郁的辨证方面。其他，如恶寒非寒、恶热非热之论，养老、慈幼、茹淡、节饮食、节情欲等论，大都从养阴出发，均对后世有深远的影响。丹溪学说，不仅在国内影响深远，而且在15世纪时，由日本人月湖和田代三喜等传入日本，成为沿用至今的日本汉医的辨证纲领。日本又成立“丹溪学社”，进行研究和推广。迄今日本尚存“丹溪学社”。日本仅医滩、气、血、水病因学说，由张仲景的水饮和朱丹溪所创之气、血、痰演化而来。
朱丹溪得罗知悌之学后，不断进行实践，又集张子和、李东垣二家之长处，将刘完素之说一变而为阴虚火旺之说，专攻于泻相火、补真阴，形成丹溪学派。
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