1969年他被下放到江苏省句容县的省“五七”干校，继续接受“审查”和参加劳动。他在干校3年时间，协助校部创建了一所中药厂，并利用这个药厂进行中药剂型改革的研究。他先后为药厂设计和生产了几十个品种，如“感冒冲剂”、“肝炎冲剂”、“气管炎片剂”、“冻疮防治冲剂”、“复方刺五加片”、“珠光层粉”、“溃疡丸”等，由于价廉效佳，剂型新颖，服用方便，深受群众欢迎。同时，也为剂型改革的研究积累了经验。 自1973年起，叶桔泉任南京药学院（中国药科大学前身）副院长，院学术委员会副主任，还兼任了社会上许多学术组织的领导职务。在此期间，他曾多次向政府和有关方面建议，要重视发展中医中药，集中力量研究中药，改进中药剂型，开发药材资源。
他多次提醒人们：中国古代医书记载的中药大约有5000多种，但没有发现、没有记载的就更多了。就是有记载的这5000多种，人们也逐步发现，它们距离“物尽其用”还十分遥远。他一再呼吁，不要埋没了药“才”。
他发现，被人们称为“五加皮”的药材，实际上是萝藦科的“红柳”，也叫“北五加”，而真正的五加科的“五加皮”，在药店中早已绝迹了。他考证了许多古书，并结合采药进行了很多调查，终于得出了东北满山野生的“刺五加”才是真正“五加皮”的结论，并发表了论文。结合自己的临床观察，他证明所谓“北五加”的“红柳”虽也能治风痛，但有小毒，“真五加”即“刺五加”则是与人参同科的亲缘植物，有和人参类似的功效。此后，在他的带动下，各种剂型的“刺五加”大量投产，既满足了国内市场的需要，又大量出口换回了外汇。从此，野生野长的“刺五加”一时身价倍增，成了俏货。
在此期间，叶桔泉发掘出来的不仅仅是一个“刺五加”，花粉也是一例。80年代初，欧美各国出现了“花粉热”。他感慨地说，外国人把花粉作为营养品用于食疗，并应用于抗衰老和强力美容剂，这不是新招。中国早在《神农本草经》中，就有香蒲，松花花粉，白莲花蕊须，梅、桃、梨等花蕊供食疗的记载。把花粉用来“驻颜耐老”，有久服“轻身延年”之说。所以，中国也应当开发花粉资源。他到处呼吁，发表文章。他说，据统计，全国有650万群蜜蜂，每群蜂一个月就能生产3公斤花粉，这是多大的一笔财富啊！他的建议，在国内引起强烈反响。中国已有数十种花粉食品和药物投放市场，有的已打入国际市场。
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