任应秋不独是研究《内经》的专家，而且对张仲景的《伤寒论》、《金匮要略》也极有研究。晚年更集一生研究之学力，进一步深入研究仲景之学，为弘扬仲景之学，促进中日学术交流作出贡献。1980年应日本东洋医学研究会之邀东渡日本，以《中医学基础理论六讲》为题，进行学术交流。鉴于日本汉方医学界推崇张仲景《伤寒论》，并在仲景学术思想研究方面独具特色，任应秋此次日本之行还促成了1981年北京第一届张仲景学术思想研讨会的召开。1982年，在张仲景的故里南阳市又召开了张仲景学术研讨会。全国研究张仲景学说的专家有300余人云集南阳，日本的两个代表团应邀参加了大会，任应秋被推举为大会执行主席之一。这些活动促进了国内外对仲景学说的进一步研究。
· 在张仲景的故里南阳市
有一所明代纪念张仲景的医圣祠，1959年，曾进行修复，在“文化大革命”中又遭破坏。1976年以后，当地政府及有关部门要求修复此祠，任应秋对此举大力支持，多方呼吁，促成了1982年医圣祠第一期修复工程胜利竣工，使得首届仲景学说讨论会在医圣祠召开。1981年冬，为庆祝医圣祠重葺并张仲景研究会成立，任应秋以五言古诗纪念张仲景，表达了他对张仲景学术的重视与弘扬精神，诗云：
仲景医中圣，伤寒发宏论
上以疗君亲，下以救万姓。博采众方书，素难为龟镜。皇皇十六卷，言精而意蕴。三阴与三阳，平脉以辨证。三百九七法，足以概诸病。一百十二方，变化无穷尽。汉季兵燹多，文献遭蹂躏。江南秘不传，思邈抱怨恨。幸有王叔和，魏晋太医令。祖述大圣人，殷勤求古训。遗编赖以传，薪火续余烬。远被扶桑国，多纪善考证。矢志崇古方，明辨而笃信。庚申来南阳，宫墙仰万仞。乃见庙倾颓，满目荒凉甚。可钦诸地委，大力为整顿。鸠工以修葺，祠宇复幽峻。研究所建立，规划已订定。绝学赖以彰，循序而渐进。古义与新知，无一非学问。继承斯发扬，攀登勤为径。愿与诸君子，砥砺共驰骋。振兴中医学，且为万世庆。
这篇发自肺腑的诗文，由任应秋手书汉隶镌刻成碑，矗立在南阳市医圣祠群碑之中。
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