理论
南阳医圣祠(2005年8月)《汉书艺文志》中，将汉之前的医学典籍总结为为重视经络针灸的医经派，与重视本草汤液的经方派二者；这两大传统的发展，形构了汉之前的中医体系。医经派的主要代表著作， 《黄帝内经》 ，传统上认为，是伤寒论成书的主要依据，后世医者也多援引内经以发明伤寒论微旨。如清朝《医宗金鉴》〈伤寒论注序〉：“《伤寒论》，后汉张机所著，发明内经奥旨者也，并不引古经一语，皆出心裁，理无不该，法无不备，盖古经皆有法无方，自此始有法有方，启万世之法程，诚医门之圣书。”
但根据晋皇甫谧序《针灸甲乙经》：“仲景论广伊尹《汤液》为数十卷，用之多验。”以及近代从敦煌出土的梁陶宏景《辅行诀脏腑用药法要》记载：“汉晋以还，诸名医辈：张机、卫汛、华元化、吴普、皇甫玄晏、支法师、葛稚川、范将军等，皆当代名贤，咸师式此《汤液经法》，愍救疾苦，造福含灵。”“外感天行，经方之治有二旦、六神、大小等汤。昔南阳张机，依此诸方，撰《伤寒论》一部 ，疗治明悉，后学咸尊奉之。”《汤液经法》一书，在汉书艺文志的分类中，属于经方一派。这证明传统上认为伤寒论“不引古经一语”的看法是错误的，伤寒论中所使用的方剂，主要援引自已失传的《汤液经法》，这也是张仲景著作的主要依据。
在这部著作中，他创造了世界上3个第一：其一是首次记载了人工呼吸急救措施的具体使用，在遇到自缢而又时间不长者，应该马上施行人工呼吸。其方法是“徐徐抱解，不得截绳，上下安被卧之，一人以脚踏其两肩，手少挽其发，常弦弦勿纵之；一人以手按柔胸上，数动之；一人摩捋臂胫屈伸之。若已僵，但渐渐强屈之，并按其腹，如此一炊顷，气口出，呼吸，眼开，而犹引按莫置，亦勿苦劳之。”
国外最早研究人工呼吸法者要算是比利时的著名解剖学家维萨留斯，他是在16世纪时发现，只要给剖开胸膛的运动的肺吹气，这只动物的心脏就能维持更长的跳动时间。这也只限于动物的实验，还没有真正应用到人体。直到1879年，拉波德才把人工呼吸法施于人体，用以急救某些濒于死亡的患者。这比张仲景的记录晚了近16个世纪。
这也是几千年来中医长盛不衰，至今仍能傲立于世界医林的“拿手绝活儿”，也就是通过望、闻、问、切四诊，综合分析疾病的性质，因人、因病、因证来选方用药，这才符合变化的病情和不同体质的病人，才能做到药到病除。也可以说，整部《伤寒杂病论》就是针对当时医生不能具体分析，准确方用药而著述的一部“纠偏”之书，其中许多条文都是针对所谓“坏症”，就是医生误治后出现的问题而进行纠正性治疗的。
因此，张仲景可说是两汉医经、经方二派的集大成者，他使用的方剂很多是来自经方派；而六经辨证的手法，则是来自《黄帝内经》；此外，更加上他个人的心得与经验。将伤寒与杂病共论，汤液与针灸并用，打破了《素问热论》 中六经只辨伤寒的局限性，因此，无论伤寒、杂病和它们互相挟杂的复杂问题， 都能用六经辨证方法概括而无遗。称仲景为医中之圣，伤寒论为中医之魂，实不为过。
张仲景的著作在中医领域内影响深远，远自晋朝王叔和，唐朝孙思邈，下至金元四大家，清朝叶天士、吴鞠通，无不是由钻研仲景学之后，才能卓然成家。历代注解伤寒论者，不下数十家，各有见解，这也推动了中医思想的不断进步。至明清时，伤寒论中的方剂，被尊为“经方”，影响远及朝鲜、日本。
张仲景在医治疾病的实践过程中，发现预防疾病是很重要的，提出了“治未病”的理论。所谓“治末病”，就是要从健康时入手，要保持人体强壮，增加抵抗能力，这样就可以抵御外邪对人体的侵害。为此，他主张饮食应有节制，起居应有规律，劳逸要适度，讲究卫生，锻炼身体，蓄养精正之气，这样就能保证身体健壮。
张仲景还以他的朴素辩证法思想，参考古医书的“六经分症”原则，把外感热病发展过程中的症状，概括为六大类型，即太阳、少阳、阳明、太阴、少阴、厥阴。他认为这六经病都不是孤立的，而是有机联系，并能互相转化的。张仲景还把他在临床实践中观察到的各种症侯，总结为八种，即后人所谓“八纲”辩证方法。所谓“八纲”，即阴、阳、表、里、寒、热、虚、实。利用“八纲”，可以辨视疾病属性，全面认识疾病，以便合理治疗。他的“六经”、“八纲”，至今仍为中国医学界临床治疗所运用。
书籍
建安年间，张仲景行医游历各地，亲眼目睹了各种疫病流行对百姓造成的严重后果，也借此将自己多年对伤寒症的研究付诸实践，进一步丰富了自己的经验，充实和提高了理性认识。经过数十年含辛茹苦的努力，终于写成了一部名为《伤寒杂病论》的不朽之作。这是继《黄帝内经》之后，又一部最有影响的光辉医学典籍。
《伤寒杂病论》是集秦汉以来医药理论之大成，并广泛应用于医疗实践的专书，是我国医学史上影响最大的古典医著之一，也是我国第一部临床治疗学方面的巨著。张仲景救人图 《伤寒杂病论》的贡献，首先在于发展并确立了中医辨证论治的基本法则。张仲景把疾病发生、发展过程中所出现的各种症状，根据病邪入侵经络、脏腑的深浅程度，患者体质的强弱，正气的盛衰，以及病势的进退缓急和有无宿疾（其它旧病）等情况，加以综合分析，寻找发病的规律，以便确定不同情况下的治疗原则。
他创造性地把外感热性病的所有症状，归纳为六个证候群（即六个层次）和八个辨证纲领，以六经（太阳、少阳、阳明、太阴、少阴、厥阴）来分析归纳疾病在发展过程中的，演变和转归，以八纲（阴阳、表里、寒热、虚实）来辨别疾病的属性、病位、邪正消长和病态表现。由于确立了分析病情、认识证候及临床治疗的法度，因此辨证论治不仅为诊疗一切外感热病提出了纲领性的法则，同时也给中医临床各科找出了诊疗的规律，成为指导后世医家临床实践的基本准绳。
《伤寒杂病论》，是一部阐述多种外感疾病的专著。全书共１２卷，２２篇，39７法。除去重复之外共有药方１１２个。全书重点论述人体 感受风寒之邪而引起的一系列病理变化和进行辩证施治的方法。他把病症分为太阳、阳明、少阳、太阴、厥阴、少阴六种，即所 谓"六经"。对于六经所系的脏腑经络的病理机转加何进行辩证施治，他作了具体论述。这就是，根据人体抗病力的强弱，病势的进退缓急等方面的因素，将外感疾病演变过程中所表现的各种症 候改进行综合分析，归纳出它的症候特点、病变部位、损及何脏何腑，以及寒热趋向、邪正盛衰等作为诊断治疗的依据。对于病在 表，或正盛邪衰的三阳证（太阳、阳阴、少阳），治疗时应以祛邪 为主，对于三阴证（太阴、骄阴、少阴），因为是寒邪入里，正虚阳衰，抗病力弱，所以治疗时就应以扶正为主。在《伤寒论》的各篇中，六经病的不同症候，又贯穿着阴阳表里寒热虚实（即所谓八纲）的基本内容。
《金匮要略》是诊断和治疗各种疾病的专书。共计２５篇，皿205个方，第一篇相当于总论，从脏腑经络为纲，概括地论述了疾病的病因、病机、预防、诊断和治疗；第十篇论述外科疾病的诊治；第二十至二十二篇论述妇产科疾病的脉症和治疗，最后三篇论述有关食物的禁忌和治疗方法，其余各篇属于内科杂病的。全书包括了四十多种疾病的诊治。
除了《伤寒论》和《金匿要略》外，张仲景还写了很多著作，如《评病要方》、《五藏论》、《口齿论》等，可惜均已失传。
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