引起感冒的原因主要有病原体感染和身体防御能力降低两个方面的因素。
一、病原体感染
病毒和细菌都可以引起上呼吸道（鼻腔一咽喉）感染，尤以病毒为多见，约占原发性感染的90％以上。病毒侵入上呼吸道黏膜，与黏膜细胞表面受体结合进人细胞内，在黏膜细胞内增殖、播散，使上呼吸道产生炎症反应，上皮细胞变性、坏死和脱落导致鼻腔及咽黏膜充血、水肿和炎细胞浸润，有浆液性及黏液性炎性渗出，黏液分泌增加，纤毛运动障碍，影响呼吸道通畅，引起鼻塞、流涕、打喷嚏、咳嗽、咽痛等症状。病毒在繁殖过程中分泌的毒素刺激机体产生内热源，内热源作用于体温调节中枢，使体温调定点提高，导致机体产热增加，散热减少，引起发热。
这些病变一般仅限于上呼吸道，少数情况下，可能延及下呼吸道。经过病毒感染后，由于上呼吸道黏膜的破坏使其抵抗力降低，细菌可乘机侵入，而容易并发细菌感染。
常见病毒中，由鼻病毒引起的约占感冒总数的50％，冠状病毒约占15％－20％，感腺病毒约占10％，柯萨奇病毒、埃可病毒以及其他肠道病毒约占10％，呼吸道合胞体腹病毒约占5％～10％，其他为类流感病毒等。
细菌感染可直接或继病毒感染之后发生，常见细菌感染以溶血性链球菌最为多见，其次为肺炎球菌、葡萄球菌、流感杆菌等。其感染的主要表现为鼻炎咽喉炎或扁桃腺炎。
病毒存在于患者的呼吸道中，在患者咳嗽、打喷嚏时从呼吸道分泌物中排出，并经飞沫传播。流感的传染性很强，由于这种病毒容易变异，即使是患过流感的人，当下次再遇上流感流行，他仍然会感染，所以流感容易引起暴发性流行。一般在冬春季流行的机会较多，每次可能有20％～40％的人会传染上流感。
二、身体防御能力降低
感冒原因不但取决于病毒或病菌的侵入，而且与身体的防御能力密切相关。人的上呼吸道中，正常情况下存在着一定的病毒和细菌，由于人体具有较强的防御能力，正常情况下不致于引发疾病。在气候多变的季节，如春季、秋冬之交，多数人呼吸道的适应性下降，或者当有受凉淋雨过度疲劳等诱发因素使全身或呼吸道局部防御功能降低时原已存在于上呼吸道或从外界侵人的病毒或细菌可在局部迅速繁殖引起发病。尤其是老幼体弱或有慢性呼吸道疾病，如窦炎扁桃体炎者更易患病。
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